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DESCRIPTION:OBJECTIFS\n- Comprendre les principes des méthodes d'analyse d
 e données de séquençage à haut débit\n- Comprendre les résultats obt
 enus\, les paramètres et leurs impacts sur les analyses\n- Savoir choisir
  et utiliser les principaux outils d'analyse\n- Être autonome pour utilis
 er un pipeline d'analyse\n- Savoir manipuler les fichiers de séquences : 
 préparation et filtration\n- Savoir évaluer la qualité des données\n- 
 Savoir analyser les résultats avec ou sans génome de référence\n\nPRÉ
 REQUIS\n- Notions de base en informatique : fichiers\, répertoire...\n- N
 otions du système linux et des lignes de commande\n- Niveau master \n\nPR
 OGRAMME\n- Linux : commandes de base\n- Les données NGS : fichiers\, mani
 pulation de base\, nettoyage\n- Mapping : principaux outils et pratique\n-
  Transcriptomique :\n. analyse de RNA-seq : expression différentielle des
  gènes / des ARNs (comptage et DESeq2) \; comparaison d'échantillons iss
 us de conditions différentes\n. post-analyse : analyse GO\, interrogation
  bases de connaissances (ex : KEGG)\, création de graphique (en R)\n. ana
 lyse couplée transcriptome / traductome
SUMMARY:New session of Bioinformatique pour le traitement de données de s
 équençage (NGS) : analyse de transcriptome
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 rmat=json-ld
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